2014年12月22日月曜日

主な次世代シーケンサーの原理・特徴と市販・開発状況(2015年版)

 GOクラブでは、2012年、2013年と年末に次世代シーケンサーの分類および各機種の状況について紹介してきた。今回の記事では、昨年に引き続き、2014年末時点での主な第2世代、第3世代(第4世代と呼ばれるものも含める)シーケンサーの原理・特徴ならびに市販・開発状況に関してまとめたので、紹介する。

2014年12月5日金曜日

Helicosの次世代シーケンサーが復活:SeqLLがサービスを開始

 世界で最初にDNA/RNAの1分子シーケンシングを実用化したHelicos Biosciences Corporation (Helicos) は、NASDAQに上場を果たした後、2012年11月に破産により活動を終えた。しかし、最近SeqLL, LLC (SeqLL) がHelicosの資産を承継し、受託シーケンシングサービス事業を開始することをアナウンスした。今回のGOクラブでは、Helicosの次世代シーケンシング(NGS)技術とSeqLLの事業を紹介する。

2014年11月25日火曜日

メタゲノム・ビジネス(4):マイクロバイオーム解析企業uBiomeの興味深い資金調達法

  前回のGOクラブで、一般市民向けのゲノム解析ビジネスである「マイクロバイオーム解析サービス」を立ち上げた、uBiome, Inc. (uBiome) を紹介した。uBiomeはクラウドファンディングによる資金調達後、Y combinatorの支援を受け、本格的なベンチャー企業として活動を始めた。今回のGOクラブでは、uBiomeの興味深い資金調達法について紹介する。

2014年11月11日火曜日

メタゲノム・ビジネス(3):uBiomeが推進する市民科学

 GOクラブでは、「メタゲノム・ビジネス」の特集シリーズとして、9月9日号、10月9日号と2回話題を提供してきた。今回のGOクラブでは、多数登場したマイクロバイオームベンチャーの中でも、異色の活動を行っているuBiome, Inc. (uBiome) の取り組みを紹介する。

2014年10月21日火曜日

Oxford Nanopore、新しいナノポアシーケンー“PromethION”を発表!

 9月25日付のGOクラブで、Oxford Nanopore Technologies Ltd. (Oxford Nanopore) が開発を進めている新しいナノポアシーケンサー“PromethIONシステム”の情報を提供したが、つい最近Oxford Nanoporeは、ホームページ上でPromethIONシステムの情報を公開した。また、Birmingham大学のNick Loman氏とOxford NanoporeのCTOであるClive Brown氏との情報交換(YouTubeで公開中)から、ポータブル・ナノポアシーケンサー“MinION”も実用レベルの性能を確保したこともわかった。今回のGOクラブでは、これらナノポアシーケンサーの最新情報を紹介したい。

2014年10月9日木曜日

メタゲノム・ビジネス(2): ヒト・マイクロバイオーム・ベンチャー企業の紹介

 ヒト腸内に棲む微生物群(Human Microbiome; ヒト・マイクロバイオーム)の種類は、健康状態によって異なることが明らかになっている。このヒト腸内微生物群の次世代シーケンシング(NGS)解析を、健康・疾病モニタリングや創薬に活かすことを目指すヒト・マイクロバイオーム・ベンチャー企業が米国を中心に多数誕生した。今回のGOクラブでは、これらベンチャー企業の概要について紹介する。

2014年9月25日木曜日

Illuminaに対抗できる次世代シーケンサー、登場か?

 これまでに膨大な種類の次世代シーケンシング (NGS) 技術が開発され、既に8タイプ(454、Illumina、SOLiD、Helicos、Complete Genomics、Polonator、Ion Torrent、Pacific Biosciences)の次世代シーケンサーが世に送り出された。そのような中で、Illuminaが今年初めに発売したHiSeq X Tenによって、ついに“1000ドルゲノム”は達成され、今もIlluminaの独走状態が続いている。しかし最近、Illuminaの独走を止める可能性がある次世代シーケンサーに関するニュースが出てきたので、今回のGOクラブで紹介したい。

2014年9月9日火曜日

メタゲノム・ビジネス(1):メタゲノムをいかにビジネスに結びつけるか

 近年、メタゲノム解析、特にヒトに棲む微生物集団のゲノム解析を医療やヘルスケアに応用することを目指すベンチャー企業が欧米で多数設立され、活発に活動している。GOクラブでは、メタゲノムをビジネスに結び付ける最近の動向を、シリーズ記事として紹介したい。