マイクロ流路技術を用いた１細胞分離とゲノムシーケンシング

　今年6月26日付のGOクラブで１細胞解析の意義について紹介したが、Stanford大学のQuark教授らがマイクロ流路技術を用いてヒト精子を１細胞ずつ分離し、同一男性由来の計91個の精子の全ゲノム配列決定を行った研究成果が7月20日付のCell誌に発表された。今後もマイクロ流路技術を用いた単細胞分離とゲノム解析／RNA解析の研究報告が多くなるだろう。前回のGOクラブでは、１分子DNA解析に利用できるRainDance Technologies（RainDance社と略す）の新しいDigital PCR機器を紹介したが、今回のGOクラブでは、同じRainDanceが開発を進めている１細胞分離技術について紹介する。また、GigaGen, Inc.もMicrofluidics技術を用いた１細胞分離技術の開発を進めているので、GigaGenの取り込みについても紹介したい。

RainDance Technologies の新しいDigital PCR機器

　RainDance Technologies（RainDance社と略す）は、新しいDigital PCR機器である“RainDrop Digital PCR System”のFirst Access Programの開始を7月26日にアナウンスした。6月26日付のGOクラブで、ゲノム/DNAの1分子解析においる次世代シーケンサーとDigital PCRの利用について述べたが、今回のGOクラブでは、この新しいDigital PCR機器を紹介するとともに、次世代シーケンサーとの比較について論じる。

Complete Genomicsの新技術： 高精度全ゲノムシーケンシングとハプロタイピング

　以前のGOクラブで、「ヒト全ゲノムシーケンシングの受託解析企業であるComplete Genomicsは、IlluminaやIon Torrent (Life Tech）などどの競争が激化し、苦戦が続くであろう」と考察した。その後も、業績は上向かず、今年6月5日には従業員約20％にあたる55人の解雇を発表した。Complete Genomicsは、7月12日に「10～20細胞からの高精度ヒト全ゲノムシーケンシングとハプロタイピングの論文がNature誌に掲載されたこと」をプレスリリースした。この発表が注目を集め、株価も約50％上昇した。今回のGOクラブでは、Complete GenomicsがNature誌で公開した「Long Fragment Read（LFR）技術」を紹介するとともに、Complete Genomicsの今後の展開の可能性について考察してみたい。

新・次世代シーケンサーの新しい分類について考える

　GOクラブでは、次世代シーケンサーの開発競争が「高機能かつ安価な機器・方法」を目標に行われていることから、シーケンシング原理別に第１世代～第４世代に分類し、次世代シーケンサーに関する情報提供を始めた。また、第２世代シーケンサーの進歩などを吟味し、次世代シーケンサーを用途別に分類すると、別の世界が見えてくることも以前考察した。DNA・RNAの調製・精製のトップメーカーであるQIAGENが、6月25日付けのプレスリリースで「Intelligent Bio-Systems（IBS）の買収」を発表した。今回のGOクラブでは、この買収の意味を「用途や利用形態に基づく次世代シーケンサーの新しい分類」の脈絡の中で考察してみたい。

未来を考える（第４回：種、個体、１細胞、そして１分子へ）

　ゲノムシーケンシングをベースとするオミックスの発展は、生命科学に新しい広大な未開拓地があることを教えてくれた。同時に、我々の生命に対する理解に対して一部思い込みがあることも知らされた。種、個体、１細胞、そして１分子レベルでのシーケンシングにより、生命の真実の姿が見えてくる。今回のＧＯクラブでは、１細胞レベルと１分子レベルでのゲノム解析について、最近のトピックスを交えて考察してみたい。

個別化化粧品と使い捨て半導体DNAセンサー

　これまでのＧＯクラブでは何回かに渡って、携帯可能な次世代シーケンサーに関する話題を提供してきたが、特定のDNAの検出や定量に利用するポータブル半導体デバイスの開発も進んでいる。しかもIon TorrentのシーケンサーのIonチップのように、半導体チップの多くは使い捨てとなる。今回のＧＯクラブでは、DNA Electronics Ltdが開発を進める「使い捨て半導体DNA分析デバイス」を紹介する。また、On-the-site（顧客を前にした現場）で遺伝型解析サービスの提供を企画しているGeneONYX Ltdとの連携による「個別化化粧品」サービスの展開についても紹介する。

いつでもどこでもシーケンシング

　Oxford Nanopore Technologies (Oxford Nanopore) がUSB駆動のポータブルDNAシーケンサーの発売を発表したが、いよいよ、いつでもどこでもシーケンシングできる時代を迎える。2010年11月のGOクラブの企画「次世代シーケンサーの新しい分類について考える」において、「５年後（2015年）くらいには携帯可能なポータブルシーケンサーも使われるようになるであろう」と述べたが、時代は予想より速いスピードで進んでいる。これまでのGOクラブでも種々の次世代シーケンシング技術を吟味・考察し、ポータブルシーケンサーとしてはナノポアシーケンサーが主流になると予想した。ところが、LaserGenの最近の発表を見ると、第２世代技術でもシーケンサーのポータブル化が可能であることがわかった。今回のGOクラブでは、このLaserGenのポータブルDNAシーケンサーを中心に、ポータブルDNAシーケンサーの開発の現状について紹介する。

Nature Biotech誌の論文をもとにナノポアシーケンシングの欠点を考察する

　Oxford Nanopore Technologies (Oxford Nanopore) が、今年2月17日にナノポアシーケンサーを今年中に発売することを発表したが、そのシーケンシング技術を科学的に裏付けるデータや論文を発表していない。一方、AkesonらのグループとGundlachらのグループがそれぞれタンパク質ナノポアを用いてシーケンシングが行えることを実証した論文をNature Biotechnology誌4月号に発表した。今回のGOクラブでは、これら論文のエッセンスを紹介するとともに、論文のデータからナノポアシーケンシング技術の欠点について考察してみたいと思う。