次世代シーケンサーの短所を相補するBioNanomatrixの1分子DNA解析技術

　次世代シーケンサーはDNA/RNAの1次構造解析に対して優れた性能を有する。ただし、次世代シーケンサーを用いた場合、Copy Number Variationなどのリピート配列や大きな挿入変異などの解析では精度が落ちる上、コンティグのアセンブリーに関しても問題が発生することが多い。一 方、BioNanomatrixやOpGenが開発した1分子DNA構造解析技術は、この次世代シーケンサーの短所を相補する特徴を有する。今回は、 BioNanomatrixの1分子DNA構造解析技術と分析機器nanoAnalyzer 1000を紹介する。

予想外の優れた性能を有するIlluminaの新シーケンサーMiSeq

　第2世代シーケンサーは、ライブラリー調製とDNA増幅に時間がかかる上、DNAの逐次的合成を行うためにシーケンシング時間の短縮も困難であると考えられてきた。Illuminaは、2011年1月11日に、この常識を覆す新しい第2世代シーケンサーであるMiSeqシステムを近々発売することを発表した。MiSeqのシーケンシング時間は、Illuminaの従来機と比べると、概ね10分の1になり、ライブラリー調製からデータ分析までの時間は最短で8時間となる。今回は、この想定外の優れた性能を有するMiSeqを紹介する。